乳酸菌飲料可分為單一乳酸菌飲料和多種乳酸菌飲料。其中單一乳酸菌飲料常用的菌種是干酪乳桿菌，多種乳酸菌飲料目前比較流行，使用的菌種包含雙歧桿菌、嗜熱鏈球菌、保加利亞乳酸菌等，此外，還有一些品牌在菌種的標(biāo)示上也充滿噱頭，如“AB菌全覆蓋”、“B益暢菌”等。
目前規(guī)定允許使用的菌種將近20個。相比單一菌種，復(fù)合菌種的使用在工藝上要求更加嚴(yán)格�！坝械漠a(chǎn)品聲稱含有多種乳酸菌，但如果每種菌種在數(shù)量上并未保持平衡性，也就有可能不好區(qū)分是哪一菌種在起主導(dǎo)作用。另外，各種菌種均有各自的功能特性，具體飲用效果還取決于菌種之間的共生能力，因此含的菌種多也不一定能說明你的產(chǎn)品就好。”
此外，美國普度大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物系食品工程專業(yè)博士云無心此前也曾表示，現(xiàn)在很多菌種對人體的作用機制科學(xué)家尚未完全搞清楚，普通消費者沒必要為了花哨的菌種名稱而選購某個產(chǎn)品。
除了所使用的菌群不同，乳酸菌飲料所含活菌數(shù)量也不相同。其中，養(yǎng)樂多含菌數(shù)量為≥1×108cfu/ml(每毫升樣品中含菌量)，君樂寶每日活菌900ml的含菌數(shù)量為≥108cfu/ml。有的品牌則只在包裝上標(biāo)明含“300億活性乳酸菌”。
乳酸菌飲料含菌數(shù)量的單位，國家標(biāo)準(zhǔn)是用106cfu/ml來表示，如產(chǎn)品內(nèi)含同種乳酸菌，活菌數(shù)高的當(dāng)然比低的好，但乳酸菌若是不同種類，僅僅比較活菌數(shù)就不見得有意義，因為不同種類乳酸菌對人體產(chǎn)生影響所需要的數(shù)量不同。營養(yǎng)專家范志紅也表示，并非活菌數(shù)量越多越好，要根據(jù)不同菌群的具體作用而言，例如人體對與抑制腸道有害細(xì)菌和免疫調(diào)節(jié)作用的乳酸菌需求量都不相同。
低糖也是一些乳酸菌飲料宣傳的賣點之一。但仔細(xì)閱讀活性乳酸菌飲料的營養(yǎng)成分表就會發(fā)現(xiàn)，這類飲料其實并不低糖，反而高糖。以宣稱低糖低卡路里的君樂寶每日活菌(900ml)為例，其每百毫升碳水化合物為4.8克，含糖量為4.3克，換算下來一瓶含糖量近39克。同樣宣稱低糖的味全含糖量則更高，每百毫升高達(dá)15.1克，喝下一瓶435ml的飲料，糖攝入量高達(dá)66克�？蓸返暮橇渴秋嬃现衅叩模还�330ml的可口可樂含糖量約為34克，僅為味全乳酸菌飲料的糖含量的一半。
乳酸菌飲料含糖量的國家標(biāo)準(zhǔn)為每100ml不得超過8%�，F(xiàn)在雖有部分企業(yè)使用了部分低聚果糖來達(dá)到減小含糖量的目的，也就是說可以使乳酸菌飲料的含糖量能達(dá)到5%，但使用低聚果糖成本會加大一些。
“對乳酸菌而言，糖是益生菌賴以生存的養(yǎng)料，沒有糖益生菌很快就會自行死掉。而且，乳酸菌飲料這類產(chǎn)品，如果放糖太少容易導(dǎo)致產(chǎn)酸，太酸很難入口，故只能使用糖來調(diào)和酸味和風(fēng)味，而糖太多對人體健康又不利�！�